目前，大部分高校2013年自主招生政策還未公布，但不少考生和家長非常關心如何選擇報考自主招生高校的問題。有關專家建議，考生選擇自主招生院校的關鍵要定準位，結合自身實力和特長量力而行，選擇適合自己的高校。
據了解，2001年，教育部最早在東南大學等江蘇省3所高校試行“自主招生錄取”改革，至今試點高校約90所。這些試行自主招生的高校中，既有清華、北大這樣在京綜合性知名大學，也有浙江大學、廈門大學等京外重點高校；既有北京交通大學、北京林業大學等具有行業特色重點高校，也有一些市屬高校。但是，根據往年的情況來看，有些考生和家長存在盲目申請多所學校，少則六七所，多則十幾所，只要符合條件的都想試試的問題。但實際情況是，這種做法不但沒有取得很好的效果，反而使孩子身心俱疲，影響了孩子的學習成績。此外，一些高校對參加自主招生的考生報考時還有專業要求。考生要結合個人興趣和愛好，根據招生院校要求，科學報考。
北京大學附屬中學老師白瑞介紹，考生選擇自主招生學校時，一定要結合自身的實力、特長，千萬不要盲目申請。考生不宜選擇太多學校，如果報考高校多，難免牽扯很多精力，影響正常的復習備考。考生就算獲得自主招生的優惠條件，最后錄取還要看高考成績。因此，考生在申請自主招生學校時要科學選擇，并要把主要精力放在正常的備考復習上。對于綜合成績并非頂尖，但在某一學科領域有特長或潛質的考生，不妨考慮一些有行業特色的高校，爭取選擇其在國內居于領先地位的學科。但是，參與自主招生的高校門檻都不會很低，題目難度也不會因為非“北大系”、“清華系”而有所下降。
包括北京交通大學等多所高校的招辦負責人一致認為，考生報考自主招生選擇兩三所學校比較合適，并拉開梯度。一所是想沖的學校，即如果考生獲得自主招生資格后，通過后期努力以及加分優惠，有機會考入的高校；一所是正常水平夠得著的學校，考生可以選擇自己喜歡的優勢專業；三是憑借自己的實力比較有把握考取的高校，萬一自己高考發揮失常也有機會被錄取。
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